هر پژوهشگری ممکن است در مسیر پژوهش، با چالش ها و آسیب های درونی و بیرونی بسیاری مواجه شود. حال به طور گذرا، از زاویه دید پژوهشگران و آسیب های احتمالی آنها، مروری به برخی از لغزش ها خواهیم داشت:

1. آگاهی دقیق نداشتن از روش های تفصیلی و فنون نوین تحقیق؛

2. تاثیر پذیری از موقعیت اجتماعی، فرهنگی و سیاسی؛

3. تعصب ورزی و گرایش های قومی، فرقه ای، صنفی و سیاسی؛

4. پیش داوری و اظهار نظر های شخصی به صورت خبری؛

5. دخیل کردن عواطف و احساسات در تحقیق؛

6. حب و بغض ها و میل به جلب نظر دیگران؛

7. تاثیر اوهام و خرافه ها در تحقیق در صورت عدم پیروی از روش صحیح؛

8.شخصیت زدگی بعضی از اندیش ورزان؛

9. قضاوت نادرست بر اساس شنیده ها؛

10. تعمیم و توسعه نابه جا؛

11. تحقیر و سرکوب بی اساس عقاید دیگران و …

منبع: اصول و مهارت های پایان نامه نویسی، سید حسین اسحاقی؛ ص 145